Тест на ВПЛ-DeepSeek, розроблений у лікарні Массачусетського генерала Брігема, дозволяє набагато раніше виявити рак за допомогою зразка крові, створюючи нову можливість для скринінгу раку голови та шиї, пов’язаного з ВПЛ.
Вірус папіломи людини (ВПЛ) відповідає приблизно за 70% випадків раку голови та шиї у Сполучених Штатах, що робить його найпоширенішим типом раку, пов’язаним з цим вірусом. Рівень захворюваності на ці види раку продовжує зростати щороку. На відміну від раку шийки матки, пов’язаного з ВПЛ, для якого існують усталені методи скринінгу, наразі не існує тесту для виявлення раку голови та шиї, пов’язаного з ВПЛ.
В результаті, більшість випадків діагностують лише після того, як пухлини вже розрослися до мільярдів клітин, викликаючи симптоми та часто поширюючись на сусідні лімфатичні вузли. Розробка інструментів скринінгу, які можуть виявити ці види раку набагато раніше, дозволить пацієнтам швидше розпочати лікування та покращити результати.
Виявлення раку за роки до появи симптомів
У нещодавно профінансованому федеральному дослідженні, опублікованому в журналі Journal of the National Cancer Institute, дослідники з Массачусетського університету в Брігамі продемонстрували, що їхній тест рідкої біопсії під назвою HPV-DeepSeek може виявляти рак голови та шиї, пов’язаний з ВПЛ, ще за 10 років до появи симптомів. За словами авторів дослідження, рання діагностика цих видів раку може підвищити рівень успішності лікування та зменшити потребу в агресивній терапії.
«Наше дослідження вперше показує, що ми можемо точно виявляти рак, пов’язаний з ВПЛ, у безсимптомних осіб за багато років до того, як у них буде діагностовано рак», – сказав провідний автор дослідження Даніель Л. Фаден, доктор медичних наук, член Американської асоціації хірургів, хірургічний онколог голови та шиї та головний дослідник у Науково-дослідному центрі раку голови та шиї імені Майка Тота при клініці Mass Eye and Ear, що входить до системи охорони здоров’я штату Массачусетс, штат Брігам.
«На момент потрапляння пацієнтів до наших клінік із симптомами раку їм потрібне лікування, яке спричиняє значні побічні ефекти на все життя. Ми сподіваємося, що такі інструменти, як HPV-DeepSeek, дозволять нам виявляти ці види раку на найранніших стадіях, що зрештою може покращити результати лікування пацієнтів та якість їхнього життя».
Як працює HPV-DeepSeek
HPV-DeepSeek спирається на секвенування всього геному для ідентифікації крихітних фрагментів ДНК ВПЛ, які відділяються від пухлин і циркулюють у крові. Попередні дослідження тієї ж дослідницької групи продемонстрували, що тест може досягати 99% специфічності та 99% чутливості в діагностиці раку під час першого візиту пацієнта до клініки, що є кращим показником, ніж існуючі діагностичні підходи.
Щоб визначити, чи може HPV-DeepSeek виявити рак голови та шиї, пов’язаний з ВПЛ, задовго до встановлення діагнозу, дослідники протестували 56 зразків з біобанку Mass General Brigham Biobank: 28 від осіб, у яких через роки розвинувся рак голови та шиї, пов’язаний з ВПЛ, та 28 від здорових людей контрольної групи.
HPV-DeepSeek виявив пухлинну ДНК ВПЛ у 22 з 28 зразків крові пацієнтів, у яких пізніше розвинувся рак, тоді як усі 28 контрольних зразків мали негативний результат, що свідчить про високу специфічність тесту. Тест краще виявляв ДНК ВПЛ у зразках крові, зібраних ближче до моменту встановлення діагнозу пацієнтам, а найдавніший позитивний результат був отриманий для зразка крові, зібраного за 7,8 року до встановлення діагнозу.
Використовуючи машинне навчання, дослідники змогли покращити потужність тесту, щоб він точно визначив 27 з 28 випадків раку, включаючи зразки, зібрані до 10 років до встановлення діагнозу.
Автори зараз підтверджують ці висновки в другому сліпому дослідженні, що фінансується Національними інститутами охорони здоров’я (NIH), використовуючи сотні зразків, зібраних у рамках скринінгового дослідження раку простати, легень, колоректального раку та раку яєчників (PLCO) у Національному інституті раку.