Вчені Університету в Мельбурні (Австралія) використовували технологію редагування генів CRISPR, щоб успішно заблокувати передачу вірусу SARS-CoV-2 в інфікованих клітинах людини. Про новий спосіб зупинити розмноження патогена повідомляється в статті, опублікованій в журналі Nature Communications.
Для придушення реплікації коронавsруса дослідники застосували фермент CRISPR-Cas13b, який зв’язується з певними ділянками вірусної РНК і розрізає їх. Вони націлили фермент на кілька РНК-молекул, що кодують амінокислотні послідовності S-білка, що зв’язується з рецепторами клітини-господаря, і білки нуклеокапсида – вірусної оболонки. Дослідники домоглися придушення експресії генів (сайлесінга) на моделі неживого вірусу з ефективністю в 98 відсотків.
Крім того, оптимізовані CRISPR-Cas13b (crRNA) придушували реплікацію вірусу в клітинах ссавців, інфікованих SARS-CoV-2, включаючи альфа-варіант B.1.1.7. (Британський штам). Аналіз показав, що мутації, що зачіпають один нуклеотид, не впливають на ефективність ферменту пригнічувати предкові і мутоівні штами SARS-CoV-2 в інфікованих клітинах.
CRISPR-Cas9 є генетичними «ножицями», які використовуються бактеріями в боротьбі з вірусами. Зазвичай вчені за допомогою цього інструменту змінюють нуклеотидну послідовність ДНК. Білок Cas9 розрізає подвійний ланцюжок на певній ділянці гена. Це місце (сайт) визначає напрямна РНК (sgРНК), яка зв’язується зі специфічним сайтом впізнавання, вказуючи Cas9, де потрібно зробити розріз. Якщо поруч з розрізом знаходиться відрізок ДНК, то він автоматично вбудовується в ланцюжок.